疾病是生命中重要的现象，透过这些疾病，我们看到心理、家庭、社会和灵性对身体的影响。对于那些有觉察力的人，疾病是一次提醒，提醒人们该成长自己了。系统排列将生命场域的真相呈现出来。家排师带着无惧、无为、无爱之心，陪伴案主面对生命实相，通过一句话、一个移动便能点开案主心灵的迷雾，揭开行为或者疾病背后的秘密。这一切背后的力量便是“大爱”，是空，是无为、无惧、无爱。这对于家排师，或者医务工作者来讲，是一个崭新的领域，是一个革命性的的新视野。这也是为什么家庭系统排列在医疗、教育、组织等机构中被广泛推广使用的原因。
身体疾病，例如心脏病、脑血栓、糖尿病、癌症等需要药物、手术等治疗手段，即使是有效治疗，也会有并发症或副作用，辅助心理治疗是许多大型正规医院的选择。其实很多身体疾病的成因都与人的心理有密切的关系。如果人们长期承受心理问题困扰，植物神经紊乱，内分泌失调，会导致身体疾病的产生与发展。压抑的情绪没有表达，身体会通过疾病表达出来。例如，皮肤病在表达一种涵义：别碰我，这是一种防御。脸上长痘痘在表达自己不受关注。人为什么会肥胖？因为内在脆弱，外在就得庞大些。更深层的原因，我们需要借助系统排列来完成，因为每一个人的家庭环境是不一样的，疾病的成因也千差万别。就像在莲心心理咨询中心接诊的抑郁症患者中，尽管都是抑郁情绪状态，都有自杀倾向，但心理治疗的方法是不一样的。
案例：甲状腺眼球突出
男，36岁，公务员，患有甲状腺眼球突出症，经过两年多的医学治疗，效果不明显，来到莲心心理咨询中心向家排师求助，希望家排师郭晓菲帮忙寻找疾病的根源。家排师告诉他：系统排列可以帮助来访者找到疾病的根源，属于心理治疗，药物等生理治疗仍然需要进行，两者之间不能替代，也没有冲突。
郭晓菲：现在请确认你的主题，可以吗？
来访者(开始流眼泪）：我的眼球变大了很多，挺吓人的。在国内许多大医院都检查了，没有找到具体的原因，我想通过家排看看，我这是怎么啦？
郭晓菲：我们可以通过我发现的人偶家排探索一下这个疾病的原因。
来访者：好。
郭晓菲：这种病能治愈吗？
来访者：我不知道，从前年开始，我的两个眼球在慢慢变大，也不知道以后会发展成什么样子。为此，我的老婆也和我离婚了 ，我好难过。
郭晓菲：你有几段婚姻？
来访者：四段。上大学时谈了一个女孩，我很容易就被她骗了5000元，后来也被其他人骗过，我这个人很容易上当受骗，别人给我一点点的好，我会付出很多，这些钱对于我的家庭来讲是个不小的数目。
郭晓菲让来访者从人偶中选出自己、疾病、四个女友的代表，并摆放出来。代表的位置分别是：案主的左边是疾病，右边是四位女友，六位代表紧紧地并排站着。案主说自己对于疾病一点也不排斥。
来访者：我的姑姑，她在八年前患癌症死了。在我的生命里她给了我很多帮助，我一直很感激她。
郭晓菲让他选出了姑姑的的人偶代表，此时，他开始痛哭，感觉自己没有回报姑姑，从姑姑去世后，他一直沉浸在悲痛中。透过人偶位置的摆放，呈现出案主在潜意识里想去做拯救者，她以为自己生了病，姑姑就会减轻痛苦，她想为姑姑承担。郭晓菲又让他选出父母等家庭成员的人偶代表，再次验证了这个推论。同时，案主不住的点头，说，“是的，就是这样的！我找到了疾病的根源。”